1963年，在修复莫斯科克里姆林宫的阿尔罕格尔斯克大教堂时，人们打开了伊凡雷帝及其他一些人的陵墓，对雷帝的遗骸进行了部分化学分析。分析结果表明：有大量的水银分子存在。根据法医的意见：不能完全排除用药物一下子或是缓慢地毒杀他的可能性。据此，一位研究伊凡雷帝的专家首次对传统看法提出异议，他认为沙皇是被人谋杀的。

　　而最近新的说法不断出炉，例如，“伊凡四世比人们预料的死得早”、“一个受到雷帝宠信的显贵别依斯基给了他一份医生配制的饮料，里面放了毒药”。一时之间，人们的注意力集中到“宫廷谋杀”上。

　　根据史料分析，波·戈杜诺夫的嫌疑最大，因为他对沙皇早已怀恨在心。伊凡雷帝在年过半百、身患疾病之时，还正式向英国女王伊丽莎白

　　一世的侄女求婚，这对身为贵族的戈杜诺夫及其亲属构成严重威胁。一旦伊凡四世和英国王室联姻，将对太妃戈杜诺娃·伊琳娜的丈夫——王储伊凡诺维奇极其不利。据说，有一次，暴怒的沙皇不知为了什么事情要严惩王储，戈杜诺夫想替王储求情，没想到也被伊凡雷帝一同痛打，致使戈杜诺夫在家躺了好多天不能到王宫去。而伊凡雷帝不仅对此事不感懊悔，反而对王储有了猜疑。此外，伊凡雷帝还对伊琳娜有过非分之举，也使戈杜诺夫对伊凡雷帝产生了仇恨心理。

　　而另外一位嫌疑人则是别伊斯基。据说，伊凡雷帝晚年时非常害怕在没有忏悔、没有领受圣餐礼的情况下突然撒手人寰。于是他从全国各地召来60名巫师和巫医，由卫队严加看管。每天，他派别伊斯基去了解这些人的占卜和预告，并向自己汇报。据说女巫们曾对别伊斯基讲过，天上最强有力的星宿都反对沙皇，她们甚至预言了沙皇死亡的日期。别伊斯基隐瞒了实情，然而伊凡雷帝不知道从哪里知道了预言，他情绪失控，暴跳如雷地大喊，要在预言他死亡的那一天，把那些巫师全部烧死，还要把隐瞒者别伊斯基斩首。别伊斯基等于是被伊凡雷帝逼上了绝路，于是，他和戈杜诺夫一起杀死了伊凡雷帝。